Evaluación in silico de análogos del Pazopanib para el tratamiento de Glioblastoma en receptores VEGF-2
Palabras clave:
Evaluación in- silico, Angiogénesis, VEFG-2, Análogos, Pazopanib, Quimioinformática.
Resumen
En este trabajo se reportan los resultados de la evaluación in silico de análogos del Pazopanib, fármaco empleado para la enfermedad Glioblastoma Multiforme (GBM) del tipo primario, empleando softwares quimioinformáticos (PASS, Osiris, Molinspiration) para predecir sus propiedades y bioactividad. Mediante el programa Molegro Virtual Docker (versión 6.0.1) se efectuaron corridas de las moléculas análogas propuestas del fármaco para determinar sus posibles interacciones con el receptor VEGF-2. Los resultados computacionales señalan que la molécula Pazopanib+regora mod3, muestra mejor afinidad al receptor inclusive que a la del fármaco original, además de que los resultados de filtrado quimioinformático permiten proponer a dicha molécula como un prometedor y potencial fármaco para el tratamiento de la enfermedad GBM.
Citas
OSIRIS PROPERTY EXPLORER es una herramienta que permite calcular los valores de las distintas moléculas conforme a su estructura y los valores que proporciona identificándolos por colores, así como sus propiedades de mutagénesis, absorción y su comportamiento. (Organic Chemistry Portal, 2014).
MIPC – PROPIEDAD CALCULADORA DE MOLISPIRATION es un programa diseñado para calcular las propiedades de actividad calculando su actividad biológica, determinar su SMILES, LogP, ligandos, etc, todo esto basándose en la información de moléculas orgánicas y organometálicas. (Calcularion of Molecular Physicochemical Properties. 2009).
PASS (PREDICTION OF ACTIVITY SPECTRA FOS SUBSTANCES) software conocido que evalúa el potencial biológico del fármaco, proporcionando predicciones sobre su actividad biológica en base a los perfiles virtuales y ensayos biológicos. (Way2Drug, 2011).
MOLEGRO VIRTUAL DOCKER ayuda a predecir y visualizar las interacciones de las moléculas candidatas con las proteínas especificadas. (Molegro Virtual Datasheet, 2013).
[1] Rosenthal P. J. “Antimalarial drug discovery: old and new approaches. Recuperado de: J Exp Bio. pp. 3735-3744.
[2] 2016, M. C. (n.d.). Molinspiration. Retrieved from Molinspiration Web site: http://www.molinspiration.com/cgi-bin/properties
[3] Thomas Sander, A. P. (n.d.). OSIRIS property explorer. Retrieved from Organic Chemistry portal web site.: http://www.organic-chemistry.org/prog/peo/
[4] Moscote Salazar Luís Rafael, Meneses García Carlos, Sáenz Amuruz Miguel, Penagos Pedro, Zubieta Camilo, Romero Alfredo, “Current Managment of Glioblastoma Multiforme” Revista: Ciencias Biomédicas. Vol 1. pp. 237-245.
[5] Ángel J. Lacerda Gallardo, Julio A. Díaz Agramonte, Sandro Pérez Leal, Daiyan Martín Chaviano, Yaíma Mirabal García, Norka Tacas Gil, “Glioblastoma multiforme del cerebelo,” Revista cubana de neurología y neurocirugía. vol. 1. pp. 141-143.
[6] Guevara Donde Jaime E. “Incidencia de gliomas malignos en derechohabientes del IMSS residentes en el estado de Veracruz.” revista Recuperado en Marzo 01, 2016. Sitio Web: http://www.scielo.org.mx/ scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0187-7052004000600004&lng=es
[7] Claudia Quezada, Lilia Peigñan, Rodrigo Segura, Francisco Riquelme, Rómulo Melo, David Rojas Z., Freddy Ayach, Rody San Martín, Juan Guillermo Cárcamo. “Glioblastoma multiforme y estudio de la resistencia a la quimioterapia mediada por transportadores ABC.” Recuperado en Marzo 01, 2016. Revista: Médica de Chile. Sitio Web: http://www.scielo.cl/pdf/rmc/v139n4/art01.pdf
[8] Sawyer A, Piepmeier J, Saltzman W. “New methods for direct delivery of chemotherapy for treating brain tumors.” vol. 1. pp. 141-52.
[9] Bruce, J., & Harris, J. “Glioblastoma Multiforme.” Recuperado el 08 de marzo de 2016. Revista: Practice Essentials. Sitio Web: http://emedicine.medscape.com/article/283252-overview
[10] Clínica Neruos. “Glioblastoma Multiforme.” Recuperado el 08 de Mayo de 2016. Sitio Web: http://neuros.net/es/glioblastoma_multiforme.php
[11] Vademecum. “Carmustina.” Recuperado en Mayo del 2016. Vol 1 pp. Sitio web:http://www.iqb.es/cbasicas/farma/farma04/c023.htm
[12] Vademecum. “Carmustina.” Recuperado en Mayo del 2016. Vol 1 pp. Sitio web:http://www.iqb.es/cbasicas/farma/farma04/c023.htm
[13] Sonia Jaramillo, Walter Osorio, Juan Carlos Espitia. “Avances en el tratamiento del glioblastoma multiforme.” Recuperado el 11 de marzo del 2016, vol 1. Pp. 1-3. Sitio web: http://med.javeriana.edu.co/publi/vniversitas/serial/v51n2/Avances%20en%20el%20tratamiento.pdf
[14] Monge Vega, A., Hueso, J., Baeyens, W., García Campaña, A., & Vallet Regi, M. (2004, enero 29). Nuevas Oportunidades y Tecnologías en el Descubrimiento de Fármacos y Medicamentos. Retrieved from Quimioinformática en el descubrimiento de fármacos : file:///D:/896-3591-1-PB.pdf
[15] José Darío Martínez-Ezquerro y Luis A. Herrera. (2006). “Angiogénesis.: VEGF/VEGFRs como Blancos Terapéuticos en el Tratamiento Contra el Cáncer.” Recuperado en Mayo 2, 2016. Vol. 1 Sitio web: https://www.researchgate.net/profile/Luis_Herrera12/publication/268198977_ANGIOGNESIS_VEGFVEGFRs_como_Blancos_Teraputicos_en_el_Tratamiento_Contra_el_Cncer/links/555b208808ae6fd2d828e1
[16] Peniche Trujillo, A. (2011, mayo). La quimioinformática, una herramienta eficiente para desarrollar los medicamentos del futuro. Retrieved from Quimioinformática: file:///D:/Dialnet-LaQuimioinformaticaUnaHerramientaEficienteParaDesa-3726081.pdf
[17] Esquema de los Receptores VEGFR. Unidad de Investigación Biomédica. INCAN/UNAM, 2006
[18] José Darío Martínez-Ezquerro y Luis A. Herrera. (2006). “Angiogénesis.: VEGF/VEGFRs como Blancos Terapéuticos en el Tratamiento Contra el Cáncer.” Recuperado en Mayo 2, 2016. Vol. 1 Sitio web: https://www.researchgate.net/profile/Luis_Herrera12/publication/268198977_ANGIOGNESIS_VEGFVEGFRs_como_Blancos_Teraputicos_en_el_Tratamiento_Contra_el_Cncer/links/555b208808ae6fd2d828e1
[19] DrugBank. “Pazopanib.” Recuperado en Marzo del 2016. Sitio Web: http://www.drugbank.ca/drugs/DB06589
[20] La célula y la transmisión de la señal de crecimiento y duplicación celular. Sonpavde G. ExpertOpinInvestingDrugs 2008.
[21] Monge Vega, A., Hueso, J., Baeyens, W., García Campaña, A., & Vallet Regi, M. (2004, enero 29). Nuevas Oportunidades y Tecnologías en el Descubrimiento de Fármacos y Medicamentos. Retrieved from Quimioinformática en el descubrimiento de fármacos : file:///D:/896-3591-1-PB.pdf
[22] Backwani Mukesh, Kumar Rakesh. “Molecular Docking: A Review” [Diciembre, 2011] Recuperada de: http://www.ijrap.net/admin/php/uploads/706_pdf.pdf pp. 1-2
[23] Way2Drug.com. (2011-2016). PASS online. Retrieved from Way2Drug web site: http://www.pharmaexpert.ru/passonline/index.php
[24] Thomas Sander, A. P. (n.d.). OSIRIS property explorer. Retrieved from Organic Chemistry portal web site.: http://www.organic-chemistry.org/prog/peo/
[25] 2016, M. C. (n.d.). Molinspiration . Retrieved from Molinspiration Web site: http://www.molinspiration.com/cgi-bin/properties
MIPC – PROPIEDAD CALCULADORA DE MOLISPIRATION es un programa diseñado para calcular las propiedades de actividad calculando su actividad biológica, determinar su SMILES, LogP, ligandos, etc, todo esto basándose en la información de moléculas orgánicas y organometálicas. (Calcularion of Molecular Physicochemical Properties. 2009).
PASS (PREDICTION OF ACTIVITY SPECTRA FOS SUBSTANCES) software conocido que evalúa el potencial biológico del fármaco, proporcionando predicciones sobre su actividad biológica en base a los perfiles virtuales y ensayos biológicos. (Way2Drug, 2011).
MOLEGRO VIRTUAL DOCKER ayuda a predecir y visualizar las interacciones de las moléculas candidatas con las proteínas especificadas. (Molegro Virtual Datasheet, 2013).
[1] Rosenthal P. J. “Antimalarial drug discovery: old and new approaches. Recuperado de: J Exp Bio. pp. 3735-3744.
[2] 2016, M. C. (n.d.). Molinspiration. Retrieved from Molinspiration Web site: http://www.molinspiration.com/cgi-bin/properties
[3] Thomas Sander, A. P. (n.d.). OSIRIS property explorer. Retrieved from Organic Chemistry portal web site.: http://www.organic-chemistry.org/prog/peo/
[4] Moscote Salazar Luís Rafael, Meneses García Carlos, Sáenz Amuruz Miguel, Penagos Pedro, Zubieta Camilo, Romero Alfredo, “Current Managment of Glioblastoma Multiforme” Revista: Ciencias Biomédicas. Vol 1. pp. 237-245.
[5] Ángel J. Lacerda Gallardo, Julio A. Díaz Agramonte, Sandro Pérez Leal, Daiyan Martín Chaviano, Yaíma Mirabal García, Norka Tacas Gil, “Glioblastoma multiforme del cerebelo,” Revista cubana de neurología y neurocirugía. vol. 1. pp. 141-143.
[6] Guevara Donde Jaime E. “Incidencia de gliomas malignos en derechohabientes del IMSS residentes en el estado de Veracruz.” revista Recuperado en Marzo 01, 2016. Sitio Web: http://www.scielo.org.mx/ scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0187-7052004000600004&lng=es
[7] Claudia Quezada, Lilia Peigñan, Rodrigo Segura, Francisco Riquelme, Rómulo Melo, David Rojas Z., Freddy Ayach, Rody San Martín, Juan Guillermo Cárcamo. “Glioblastoma multiforme y estudio de la resistencia a la quimioterapia mediada por transportadores ABC.” Recuperado en Marzo 01, 2016. Revista: Médica de Chile. Sitio Web: http://www.scielo.cl/pdf/rmc/v139n4/art01.pdf
[8] Sawyer A, Piepmeier J, Saltzman W. “New methods for direct delivery of chemotherapy for treating brain tumors.” vol. 1. pp. 141-52.
[9] Bruce, J., & Harris, J. “Glioblastoma Multiforme.” Recuperado el 08 de marzo de 2016. Revista: Practice Essentials. Sitio Web: http://emedicine.medscape.com/article/283252-overview
[10] Clínica Neruos. “Glioblastoma Multiforme.” Recuperado el 08 de Mayo de 2016. Sitio Web: http://neuros.net/es/glioblastoma_multiforme.php
[11] Vademecum. “Carmustina.” Recuperado en Mayo del 2016. Vol 1 pp. Sitio web:http://www.iqb.es/cbasicas/farma/farma04/c023.htm
[12] Vademecum. “Carmustina.” Recuperado en Mayo del 2016. Vol 1 pp. Sitio web:http://www.iqb.es/cbasicas/farma/farma04/c023.htm
[13] Sonia Jaramillo, Walter Osorio, Juan Carlos Espitia. “Avances en el tratamiento del glioblastoma multiforme.” Recuperado el 11 de marzo del 2016, vol 1. Pp. 1-3. Sitio web: http://med.javeriana.edu.co/publi/vniversitas/serial/v51n2/Avances%20en%20el%20tratamiento.pdf
[14] Monge Vega, A., Hueso, J., Baeyens, W., García Campaña, A., & Vallet Regi, M. (2004, enero 29). Nuevas Oportunidades y Tecnologías en el Descubrimiento de Fármacos y Medicamentos. Retrieved from Quimioinformática en el descubrimiento de fármacos : file:///D:/896-3591-1-PB.pdf
[15] José Darío Martínez-Ezquerro y Luis A. Herrera. (2006). “Angiogénesis.: VEGF/VEGFRs como Blancos Terapéuticos en el Tratamiento Contra el Cáncer.” Recuperado en Mayo 2, 2016. Vol. 1 Sitio web: https://www.researchgate.net/profile/Luis_Herrera12/publication/268198977_ANGIOGNESIS_VEGFVEGFRs_como_Blancos_Teraputicos_en_el_Tratamiento_Contra_el_Cncer/links/555b208808ae6fd2d828e1
[16] Peniche Trujillo, A. (2011, mayo). La quimioinformática, una herramienta eficiente para desarrollar los medicamentos del futuro. Retrieved from Quimioinformática: file:///D:/Dialnet-LaQuimioinformaticaUnaHerramientaEficienteParaDesa-3726081.pdf
[17] Esquema de los Receptores VEGFR. Unidad de Investigación Biomédica. INCAN/UNAM, 2006
[18] José Darío Martínez-Ezquerro y Luis A. Herrera. (2006). “Angiogénesis.: VEGF/VEGFRs como Blancos Terapéuticos en el Tratamiento Contra el Cáncer.” Recuperado en Mayo 2, 2016. Vol. 1 Sitio web: https://www.researchgate.net/profile/Luis_Herrera12/publication/268198977_ANGIOGNESIS_VEGFVEGFRs_como_Blancos_Teraputicos_en_el_Tratamiento_Contra_el_Cncer/links/555b208808ae6fd2d828e1
[19] DrugBank. “Pazopanib.” Recuperado en Marzo del 2016. Sitio Web: http://www.drugbank.ca/drugs/DB06589
[20] La célula y la transmisión de la señal de crecimiento y duplicación celular. Sonpavde G. ExpertOpinInvestingDrugs 2008.
[21] Monge Vega, A., Hueso, J., Baeyens, W., García Campaña, A., & Vallet Regi, M. (2004, enero 29). Nuevas Oportunidades y Tecnologías en el Descubrimiento de Fármacos y Medicamentos. Retrieved from Quimioinformática en el descubrimiento de fármacos : file:///D:/896-3591-1-PB.pdf
[22] Backwani Mukesh, Kumar Rakesh. “Molecular Docking: A Review” [Diciembre, 2011] Recuperada de: http://www.ijrap.net/admin/php/uploads/706_pdf.pdf pp. 1-2
[23] Way2Drug.com. (2011-2016). PASS online. Retrieved from Way2Drug web site: http://www.pharmaexpert.ru/passonline/index.php
[24] Thomas Sander, A. P. (n.d.). OSIRIS property explorer. Retrieved from Organic Chemistry portal web site.: http://www.organic-chemistry.org/prog/peo/
[25] 2016, M. C. (n.d.). Molinspiration . Retrieved from Molinspiration Web site: http://www.molinspiration.com/cgi-bin/properties
Publicado
2017-03-30
Sección
Ciencias Naturales, Exactas y de la Computación
Comunicado propuesto para los derechos de autor de Creative Commons
1. Política propuesta para revistas de acceso abierto
Los autores/as que publiquen en esta revista aceptan las siguientes condiciones:
- Los autores/as conservan los derechos de autor y ceden a la revista el derecho de la primera publicación, con el trabajo registrado con la licencia de atribución de Creative Commons, que permite a terceros utilizar lo publicado siempre que mencionen la autoría del trabajo y a la primera publicación en esta revista.
- Los autores/as pueden realizar otros acuerdos contractuales independientes y adicionales para la distribución no exclusiva de la versión del artículo publicado en esta revista (p. ej., incluirlo en un repositorio institucional o publicarlo en un libro) siempre que indiquen claramente que el trabajo se publicó por primera vez en esta revista.
- Se permite y recomienda a los autores/as a publicar su trabajo en Internet (por ejemplo en páginas institucionales o personales) antes y durante el proceso de revisión y publicación, ya que puede conducir a intercambios productivos y a una mayor y más rápida difusión del trabajo publicado (vea The Effect of Open Access).
